新闻信息

新闻动态

《公共卫生与法律法规》MOOC课程首批入选国家高等教育智慧教育平台

我院院长吴息凤教授负责的《公共卫生与法律法规》MOOC课程首批入选国家高等教育智慧教育平台,该MOOC课程也入选了全球大型的学分课程运营服务平台智慧树2021秋冬【一流高校精品课程(专业课)】,本学期共有7所学校的2527名同学选择该课程,并互动2256次。随着新冠肺炎疫情防控的常态化和“健康中国”战略的不断推进,人们对于健康的需求已经延伸到各个领域,人民健康已成为民族昌盛和国家富强的重要标志,公共卫生事业的重要性愈发凸显。公共卫生的最终目标是促进健康,延长寿命,对象是人群,实质是公共政策。公共卫生是一个社会问题而非单纯技术问题,公共卫生的实施涉及社会的方方面面,应加强医防结合和多部门协作,强调社区行动和人人参与。公共卫生领域的法律法规在维护公共卫生安全方面发挥了重要作用,目前公共卫生领域法律法规体系涉及面广,包括传染病防治法、卫生监督、检验检疫等多个方面。熟悉掌握公共卫生法律法规知识,对于解决公共卫生问题,意义重大。《公共卫生与法律法规》课程主要讲授公共卫生的内涵,健康中国战略与新时代的公共卫生,大数据在传染病、慢性病防控中的作用,公共卫生体系构架,公共卫生研究方法,医患沟通方法,医院管理法律法规,基层卫生与社区卫生服务管理,以及各项公共卫生法律法规内容,如《传染病防治法》《艾滋病防治条例》《职业病防治法》《国境卫生检疫法》等,为推进数字赋能的新型公共卫生建设,普及公共卫生法律法规知识,培养国际化复合型人才。通过对该课程的学习可了解领会公共卫生的内涵,熟悉公共卫生法律法规基本内容,能够使用公共卫生法律法规知识处理公共卫生领域工作过程中可能遇到的公共卫生问题,具备从人群角度思考公共卫生问题的能力。课程负责人介绍吴息凤教授,浙江大学公共卫生学院院长、浙江大学医学院附属第二医院副院长、浙江大学健康医疗大数据国家研究院院长、浙江大学医疗保障大数据和政策研究中心主任,国家级特聘专家,浙江省“鲲鹏计划”顶尖人才,是健康医疗大数据领域的领军科学家,研究具有鲜明学科交叉特征,横跨健康医疗大数据、生物遗传学、流行病学、精准医学等领域,并在世界学科前沿取得了一系列原创性重要成果。 MORE
2022-04-25

浙江大学-耶鲁大学环境相关疾病联合研究中心“大公卫,大健康”学术会议暨项目研讨会成功举办

2021年11月2日,浙江大学公共卫生学院与耶鲁大学公共卫生学院共同举办了浙江大学-耶鲁大学环境相关疾病联合研究中心“大公卫,大健康”学术会议暨项目研讨会。本次大会主席分别为浙江大学公共卫生学院院长吴息凤教授和耶鲁大学公共卫生学院院长Sten Vermund教授。浙江大学公共卫生学院院长吴息凤教授,副院长陈光弟教授、王红妹教授、涂华康教授,耶鲁大学公共卫生学院院长Sten Vermund教授以及Heping Zhang教授、Yong Zhu教授、Xi Chen教授、Kai Chen教授、Krystal Pollitt教授等180位师生通过线上线下的形式参加了本次研讨会。会议由涂华康副院长与耶鲁大学公共卫生学院Yong Zhu教授共同主持。致辞报告会议首先由吴息凤院长致辞并作题为“Big Data Empowered Health Research”的报告。她在报告中介绍了浙江大学公共卫生学院教育教学、师资队伍、科研平台建设等方面的基本情况。她指出浙江大学公共卫生学院将重点建设百万人群队列这一高能级公共卫生科创平台,开展大数据驱动的公共卫生与大健康研究,旨在针对不同人群,采取针对性的三级预防策略,从而实现预测、预警、预防、早诊断、早发现、早治疗、精准治疗、精准康养八位一体的数智赋能的疾病防控和健康管理体系,引领人民健康福祉不断提升。她表示浙江大学公共卫生学院和耶鲁大学公共卫生学院已经建立了良好合作关系,特别是新冠肺炎爆发之后,双方紧密合作联系共同应对新冠肺炎疫情带来的一系列变化。她指出双方已经具备良好的合作基础,可以进一步深化在教学、人才培养、科学研究等各方面的合作,共同应对全球变化对人类健康带来的挑战。耶鲁大学公共卫生学院院长Sten Vermund教授详细介绍了耶鲁大学公共卫生学院师资和学生等基本情况以及学院近期的科研情况,他表示与浙江大学公共卫生学院有非常愉快的合作经历,期待耶鲁大学能够见到更多浙江大学公共卫生学院学生和老师的身影,双方共同开展公共卫生合作研究。学术分享首先由陈光弟副院长作了题为“Health effects of antimony exposure”的报告,基于杭州市出生队列开展了11种金属暴露对人体健康的影响。其中,他详细介绍了多种金属与甲状腺激素稳态之间的关系,尤其是对于孕妇,从中揭示了锑暴露对人群健康的影响。董恒进教授在报告中介绍了目前正在开展的研究领域,分享了他在卫生政策研究、药物经济学、医疗卫生保险等方面的研究经历,旨在通过强有力的卫生政策研究提升人群健康水平,他表示非常期待能够与耶鲁大学公共卫生学院开展更加深入的合作。耶鲁大学公共卫生学院Xi Chen教授介绍了与刘足云研究员一起开展的合作研究进展,即生命周期不同阶段的一系列风险因素与衰老以及心血管疾病之间的关系,揭示了父母的健康和儿童时期的健康是衰老和晚年心血管疾病的最重要因素之一,为健康政策制定提供了科学的依据。Kai Chen教授介绍了他团队关于气候变化影响人群健康的研究进展,他们团队发现极端气候的增加会影响心血管系统疾病、泌尿系统疾病、呼吸系统疾病等,以及老年人在极端温度下更容易受到伤害,需要共同应对气候变化对人类健康带来的影响。合作研讨会议第三部分是合作研讨,双方就本科生和研究生人才培养项目进行了讨论,明确了双方科学研究合作的重点方向,进一步聚焦大数据和卫生政策研究、出生队列、肿瘤、人口老龄化等方面,为后一阶段双方深入合作奠定了良好的基础。总结本次会议通过双方深入地交流研讨,浙江大学公共卫生学院与耶鲁大学公共卫生学院形成了新的合作共识,双方将进一步巩固合作成果,扩大合作成效,深入开展科学研究,打造与世界一流高校合作新模板、新范式,助力浙江大学公共卫生学院建设成为中国特色世界一流公共卫生学院。本次会议得到了浙江大学相关国际合作专项基金的资助,会议由Yong Zhu教授、刘足云研究员和涂华康教授协作筹备完成。 MORE
2021-11-03

浙江大学-耶鲁大学环境相关疾病联合研究中心“大公卫,大健康”研究生学术交流会成功举办

2021年12月伊始,浙江大学公共卫生学院与耶鲁大学公共卫生学院共同举办了浙江大学-耶鲁大学环境相关疾病联合研究中心“大公卫,大健康”研究生学术交流会。浙江大学公共卫生学院副院长陈光弟教授、王红妹教授、涂华康教授,耶鲁大学公共卫生学院Yong Zhu教授、研究生事务主管Mary Keefe、MPH项目主管Melanie Elliot等100多位师生通过线上的形式参加了本次学术交流会。会议由浙江大学公共卫生学院刘足云研究员主持。致辞会议首先由浙大公卫学院副院长涂华康致欢迎辞,他表示双方在11月份共同成功举办的学术会议暨项目研讨会取得了预期成效。本次召开的专门针对研究生的学术交流会进一步巩固了双方密切的合作交流,共同加强了研究生教育培养。 项目介绍会议第二部分由耶鲁公卫学院MPH项目主管Mary Keefe 介绍耶鲁大学MPH项目申请的具体情况。她详细地介绍了该项目申请的必须条件,并表示非常欢迎浙大学生申请耶鲁MPH项目。紧接着,耶鲁公卫学院研究生事务主管Melanie Elliot详细介绍了博士研究生项目申请的必须条件,并表示耶鲁公卫学院能够为在校学生提供良好的科研学习环境,支持学生的学习科研活动。随后,浙大公卫学院王红妹副院长详细介绍了浙大关于国际留学项目申请的相关要求、申请流程以及奖学金申请途径等。她表示,浙大是一个开放包容的高校,学校在研究生教育培养方面具有非常丰富的经验,能够为国际交流生提供良好的生活学习环境,非常欢迎国际学生申请就读。学术报告会议第三部分分别由浙大公卫学院三位在读博士研究生以及耶鲁公卫学院三位在读博士研究生作学术报告分享。浙大公卫学院三位同学分别汇报了“零售药店与医院抗生素滥用现况调研及教育项目的真实世界研究”“探索不同疾病负担人群中,组合生活方式与癌症发病的关系”“新型多维度衰老评价指标的构建及其与死亡和慢性病的关联研究”,耶鲁公卫学院三位同学分别汇报了“环境因素与新冠肺炎传播的关系”“利用谷胱甘肽缺乏小鼠模型证明氧化应激与遗传毒性在1,4-二恶烷肝脏毒性中的作用”“温度、环境污染和肾脏疾病的关系”等研究内容,六位同学精彩的科研分享以及双方教师的互动点评进一步加强了双方师生的了解,为将来深入的合作奠定了良好的基础。交流探讨会议最后一个环节,浙大公卫学院陈光弟副院长、王红妹副院长、涂华康副院长和刘足云研究员与耶鲁公卫学院Yong Zhu教授展开了双方在科研和学生交流方面的深入探讨,并表示在疫情影响下,双方克服困难,在教师和学生层面的科研交流研讨工作进展非常顺利,这是一个良好的开端;双方有望在接下来一年取得更全方位的合作成果。本次会议得到了浙江大学相关国际合作专项基金的资助,会议由涂华康教授、Yong Zhu教授和刘足云研究员协作筹备完成。 MORE
2021-12-08

2021年海峡会 | “全球对话:卓越医疗中心的创新与高效”顺利召开

2021年11月18-20日,“第十届海峡两岸医院院长论坛”如期而至,论坛由浙江大学医学院附属第二医院、台湾台北医学大学万芳医学中心、海峡两岸医药卫生交流协会医院管理专委会、浙江省医院协会、健康界多方共同主办。我院院长吴息凤教授受邀主持“全球对话:卓越医疗中心的创新与高效”专场。“第十届海峡两岸医院院长论坛”围绕“浙大二院专场:高质量发展的思与行”“‘浙大二院-哈佛’国际医学创新论坛”、“全球对话:卓越医疗中心的创新与高效”等主题设置13个专场,邀请了美国、德国、英国等9个国家的知名医学中心的大咖与中国嘉宾共同探讨医院创新、提质增效之路。除此之外,大会还特设四场双语直播专场,吸引了国际同行上线观看,国际同行参会创大会历史新高。为了让患者得到最佳的诊疗效果和最佳的服务体验,国内外都积极探索打造卓越医疗中心的建设,推动高水平学科建设的发展。但卓越医疗中心的建设牵涉到人财物的方方面面,在建设的各个阶段总会不断面临新的机遇和挑战。因此,在“全球对话:卓越医疗中心的创新与高效”论坛中,美国约翰霍普金斯医院胰腺癌卓越中心主任郑雷;英国伦敦玛丽女王大学副校长、伦敦大学学院合作伙伴联盟常务董事Steve Thornton;加拿大多伦多成人先天性心脏病中心产科心脏病学主任Candice Silversides;英国皇家帕普沃斯医院首席执行官Stephen Posey;日本公益财团法人日中医学协会副会长、静冈县立癌症中心顾问安达勇;美国康奈尔大学医学院副院长Michael Stewart;法国巴黎公立医院集团AP-HP首席执行官Martin Hirsch;韩国延世大学医学院科研副院长Jae-Ho Cheong,围绕“行政组织管理的打通与突围”“服务过程数字化的障碍与破题路径”“人力资源高产出的现实运行场景”“医疗质量再优化的关键实施策略”“临床研究日常化的重点保障手段”分享灼见真知。 MORE
2021-11-22

研究亮点

研究亮点

2011年8月,吴息凤教授团队在《Lancet》上发表题为“Minimum amount of physical activity for reduced mortality and extended life expectancy: a prospective cohort study”的研究。该研究基于美兆健康人群筛检队列,报道了运动时间、运动量与死亡及预期寿命的关系。目前,该文已累计被引用近2000次。体育运动对健康的好处众所周知,但每周少于150分钟的运动是否会对预期寿命有好处尚不清楚。基于此,研究纳入了近42万名参与者,根据自填问卷中显示的每周运动量,参与者被分为五类运动量中的一类:不活动、或低、中、高或非常高的活动量。计算了参与运动的各组与非活动组相比的死亡率风险的危险比(HR),并计算了各组的预期寿命。结果显示:与非活动组相比,每周平均运动92分钟或每天运动15分钟的低运动量运动组的全因死亡率降低了14% (HR 0.86, 95% CI 0.81-0.91),预期寿命延长了3年。每天至少运动15分钟基础上每多运动15分钟,全因死亡率进一步降低4%(95% CI 2.5-7.0),全因癌症死亡率进一步降低1%(0.3%-4.5%)。运动的益处适用于所有年龄组和性别,以及有心血管疾病风险的人群。与低容量组相比,不活动的个体死亡率增加17%(HR 1.17,95% CI 1.10-1.24)。该研究揭示每天走路15分钟,即可延长寿命3年,减少死亡率14%。图:每日体育活动持续时间和全因死亡率降低的关系 详情

2018年1月,吴息凤教授团队在《BMJ》上发表题为“Cancer risk associated with chronic diseases and disease markers: prospective cohort study”的研究。该研究揭示了慢病导致的癌症风险与五大最大生活方式风险因素的总和相当。该研究获得广泛媒体报道,《自然综述-肾脏病学》和《新英格兰医学杂志观察》对该研究发表专题评述。该研究使用了台湾MJ队列近50万参与者的大数据。研究发现与心血管疾病、糖尿病、慢性肾脏疾病、肺部疾病和痛风性关节炎相关的标记物具有相当大的癌症风险。这些标志物共贡献癌症发生率的20.5%和癌症死亡率的38.9%,与吸烟、身体活动不足、水果和蔬菜摄入不足、饮酒和不理想的BMI这五个最大的生活方式风险因素的总和相当。慢性疾病风险评分最高的个体寿命缩短近16年。这些结果支持具有与主要慢性疾病相关的异常生物标志物的个体属于肿瘤高危个体。未来的癌症预防策略应将慢性疾病的管理作为可改变的风险因素。 详情

2018年7月,吴息凤教授团队在《Gut》上发表题为“The somatic mutation landscape of premalignant colorectal adenoma”的研究。该研究构建了结直肠腺瘤基因突变图谱并揭示了从结直肠腺瘤进展到癌症的分子生物标志物。该研究通过对149例腺瘤标本和配对血液标本进行了全外显子组测序和靶向测序。将鉴定出的体细胞突变与来自TCGA的结直肠癌(CRC)样本中的体细胞突变进行比较。确定了从大肠腺瘤到腺癌进展的分子标志物。研究发现,在非晚期和晚期常规腺瘤和大肠癌组织中,经多重比较调整后,TP53、PIK3CA、KRAS、APC和SMAD4五个基因的非沉默突变频率具有统计学意义差异。例如,大肠腺瘤中的TP53突变完全是错义突变,而大肠癌中四分之一的突变是截断突变。用随机森林分类法,鉴别出促进腺瘤进展到结直肠癌的20个最重要基因,模型AUC达0.941。图1 基因突变频率与疾病进展的关系图2 从传统腺瘤到非高突变结直肠癌恶性进展的预测模型 详情

2009年9月,吴息凤教授团队在《Nature Genetics》上发表题为“Genetic variation in the prostate stem cell antigen gene PSCA confers susceptibility to urinary bladder cancer”的研究。该研究鉴定了膀胱癌的新型遗传易感位点。该研究对来自德克萨斯州的969例膀胱癌病例和957例对照进行了全基因组关联研究。为了快速验证,研究在另外三个美国人群中评估了60个SNP位点,并在九个欧洲人群中验证了最显著的SNP。在美国和欧洲人群中,发现PSCA基因中的错义变异(rs2294008)与膀胱癌易感性具有一致的关联。综合所有受试者(6667个病例、39590个对照),总体P值为2.14×10-10,等位基因比值比为1.15(95%CI 1.10-1.20)。rs2294008改变基因起始密码子,预计会导致初级PSCA翻译产物N端信号序列中的九个氨基酸被截断。体外报告基因分析显示,变异等位基因显著降低启动子活性。PSCA基因组区域的重新测序显示rs2294008是PSCA基因中唯一常见的错义SNP。该研究表明rs2294008是一个新的膀胱癌遗传易感位点。图:8q24位点包含rs2294008 详情

2020年10月5日,周丹研究员在自然遗传杂志上在线发表题为“A unified framework for joint-tissue transcriptome-wide association and Mendelian randomization analysis” 的遗传流行病学方法学论文,创新优化了转录组关联分析。近些年,以PrediXcan为代表的转录组关联分析 (Transcriptome-wide association study, TWAS) 被广泛地应用在寻找复杂表型关联基因的遗传流行病学研究中。与基因组关联分析 (Genome-wide association study, GWAS) 相比,TWAS以转录调控作为遗传变异与表型之间的中介,将单个遗传变异与表型的关联转换成基因/转录本与表型的关联。TWAS的研究过程主要可以分成两个步骤:第一,利用基因附近(cis)的遗传变异信息构建转录水平预测模型;第二,利用模型预测研究对象的基因表达水平,并与表型做关联分析。该研究策略的优势包括:(1) 相比SNP,以基因为单位的分析具有更低的多重比较次数;(2) 结果以基因的形式呈现,其生物学意义更为直接,便于后续功能研究及成果转化;(3) 相比转录组单组学研究,以胚系基因组遗传变异为基础的转录组研究不会出现因果倒置的问题,且受混杂因素的影响较小; (4) GTEx数据库已提供了极为丰富的基因组、转录组数据,研究者可利用多达49种人体组织、细胞的资料作为参照建立模型,无需额外的样本检测即可实现从GWAS到TWAS的跃迁。虽然TWAS已获得了广泛的认可,但该研究方法仍然存在改进的空间。新方法MR-JTI在两个方面对TWAS进行了创新优化:第一,通过提高模型的预测精度增加关联分析的检验效能(power);第二,解决横向基因多效性(horizontal pleiotropy) 及潜在混杂因素带来的假阳性问题。该工作针对难点问题建立了多组织联合预测的研究方法JTI(Joint-Tissue Imputation)和基于孟德尔随机化框架的MR-JTI方法,并开发了应用软件。该方法通过借助相似组织的信息提升模型的预测精度以增加检验效能。受组织转录调控相似性的启发,原创性地融合了ENCODE等数据库中启动子区域染色质可及性和转录图谱信息,解决了如何系统化地借助组织、细胞间转录调控的相似性规律,增加基因表达预测精度的关键科学问题。交叉验证结果显示,预测精度平均提升了60.3%。同时,为解决研究中可能存在的由横向基因多效性引起的假阳性问题,创新性地将可能存在的横向基因多效性纳入模型,并通过threshold bootstrap LASSO的方法巧妙地解决了如何将工具变量的横向与纵向基因多效性分离,得到近似无偏估计值,提升因果证据强度的关键科学问题。该工作提供了所有基于2020年9月最新发布的包含人体49种组织细胞的GTEx v8基因表达数据预测模型以供下载应用。模型以.db的格式给出,与PrediXcan相一致。同时给出的还有SNP-SNP的协方差矩阵,以便熟悉S-PrediXcan的读者将最新的模型无缝地衔接到关联分析中去。该工作整合了包括基因组(GTEx)、转录组 (GTEx)、表观修饰组 (ENCODE, Roadmap)的信息,利用多个大型数据库 (PsychENCODE, GEUVADIS, UK Biobank, BioVU),不仅优化了转录组关联分析的策略,还提供了最新的数据资源以便读者使用,为复杂疾病的遗传流行病学研究提供了新的思路和资源。原文链接:https://www.nature.com/articles/s41588-020-0706-2 详情

2021年2月5日,我院徐欣课题组在阿尔茨海默病与痴呆杂志上在线发表题为 “SINgapore GERiatric intervention study to reduce physical frailty and cognitive decline (SINGER)–pilot: A feasibility study” 的研究论文。该论文探究了多领域生活方式干预对社区老年人躯体衰弱及认知功能的影响,并讨论了该干预方式在亚洲国家初级卫生保健系统下大范围推广的接受度及可行性,研究结果为痴呆防治与干预提供了新思路。徐欣研究员为本文共同第一作者及独立通讯作者。痴呆不仅给患者个人及其家庭,乃至社会都带来沉重的负担。由于痴呆存在异质性和复杂性,聚焦单一维度的干预效果不显著,其长期有效性仍不明确,因此,针对多项危险因素的多领域生活方式干预为痴呆的预防提供了希望。徐欣研究员作为全球多领域生活方式干预-WW-FINGERS(World Wide FINGERS, WW-Fingers)战略合作网络的联盟成员,在新加坡开展了相关的干预研究(SINGER),旨在探索多领域生活方式干预在亚洲国家实施的本土化调整。在本论文中,徐欣课题组对新加坡社区老年人开展了为期2年的随机对照临床试验,对干预组和对照组分别实施亚洲本土化多领域生活方式干预(SINGER)与已在欧洲人群中得到验证的干预模式(FINGER),干预内容主要包括认知干预、营养指导、体育锻炼、血管和代谢危险因素管理四个维度。研究结果显示试验中干预完成度为80%,且两种干预均能显著提高受试者躯体功能水平,除此之外,SINGER组受试者在血压控制方面表现更佳。该研究展现了多领域生活方式干预在痴呆预防中的积极作用,且该干预模式的本土化调整在亚洲社区老年人中有广阔的应用前景。该工作得到了Miia Kivipelto博士, Tiia Ngandu博士,Alina Solomon博士和FINGER 团队的帮助。原文链接:https://alz-journals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/trc2.12141图:亚洲本土化多领域生活方式干预(SINGER)的干预内容及时间轴 详情

该研究利用胃癌高危人群随访数据,对“血清学活检”结果进行了评估,并将评估结果用于识别与预测高危人群患胃癌的风险。结果发现胃蛋白酶原I(PGⅠ)、胃蛋白酶原Ⅱ( PGⅡ)、PGⅠ/PGⅡ比值(PGR)、胃泌素-17(G-17)、幽门螺杆菌抗体(H. pylori-IgG)五指标联检预测胃癌高危人群的C统计值为0.80(95% CI 0.79-0.82),显著高于传统风险因素组合( C值为0.58)。基于五种胃特异性循环生物标志物,我们开发了一项血清学活检评分系统,评分越高预测胃癌风险的能力越强(Tu et al. Am J Gastroenterol 2017)。《柳叶刀胃肠病学和肝病学》研究新闻中重点强调了上述发表于AJG的研究成果。 详情

2022年3月29日,我院吴健团队在医学人工智能顶级期刊Transaction on Medical Imaging上发表题为“A Task Decomposing and Cell Comparing Method for Cervical Lesion Cell Detection”的研究论文。该论文从临床角度出发,提出一种基于任务分解和细胞对比的方法实现在宫颈细胞学图像上的宫颈病变细胞检测。实验室博士生陈婷婷和郑文浩是论文的共同一座,吴健教授是本文的通讯作者。TCT(薄层液基细胞技术)是一种细胞学检查,是常见的宫颈癌筛查技术。近年来,在人工智能技术加持下,机器阅片具有速度快、准确率高、高并发等优势。目前以后很多深度学习方法实现TCT图像上的病变细胞智能检测,虽然取得不错的效果,但仍然面临一些困难和挑战:(1)同一种病变类别存在大的形态差异,如单个细胞和多细胞(细胞蔟);(2)正常细胞常常被忽略,正常细胞中的细胞核大小、胞质比等往往能够给异常细胞识别提供好的参考;(3)相邻癌化阶段的病变细胞形态相似,如HSIL- ASCH,LSIL- ASCUS等,给异常细胞的识别带来困难。图1. 宫颈细胞学图像分析的挑战基于以上问题,本文提出基于任务分解和细胞对比的创新方法实现TCT图像上宫颈病变细胞的检测。(1)任务分级:设计Decompose-and-Integrate的检测头结构,将病变细胞的检测任务先分解为单细胞和多细胞病变检测的两个子任务,使得模型专注于不同细胞结构的特征提取;再将单细胞和多细胞检测结果整合,通过级联结构实现最终的病变检测。(2)细胞对比:提出动态对比模块(Dynamic Comparing Module)实现正常细胞和异常细胞的对比,提出实例级对比损失(Instance Contrastive Loss)实现异常细胞和异常细胞的对比,两者旨在增强对于病变细胞特征的学习和捕捉。论文在6935例TCT图像上进行模型训练和评估,最终AP75达到25.5,相比baseline方法提升5.6.图2. 基于任务分解和细胞对比的宫颈病变细胞检测 详情

2021年9月25日,我院袁长征研究员在《美国临床营养杂志》上发表题为“Long-term diet quality and its change in relation to late-life subjective cognitive decline”研究。该研究基于美国健康护士对列(NHS),发现长期饮食质量及其改变与老年时期主观认知功能下降(SCD)的关系。我院袁长征研究员与中国科学院营养代谢与食品安全重点实验室曹亚英博士为该文的共同第一作者。袁长征研究员为通讯作者。图2. 不同膳食模式评分与主观认知下降的关联这项研究基于美国健康护士队列(NHS),共纳入49493名女性。研究团队通过膳食问卷调查结果计算受访者的替代地中海饮食评分(AMED)、控制高血压饮食评分(DASH)、替代健康饮食指数(AHEI)以反映受访者30年间的长期饮食情况;通过七个关于记忆和认知的问题来多次评估受访者的认知功能。在随访结束时,46.9%的受访者出现SCD,12.3%的受访者出现严重的SCD。研究发现,无论远期或近期AMED与DASH膳食评分均与SCD存在关系,而AHEI膳食评分仅远期评分与SCD存在关联。进一步的研究结果显示,既往膳食评分高的人群发生严重SCD的风险降低;随着时间推移,饮食得到改善的人群发生严重SCD的风险下降,膳食评分每增加一个单位,发生严重SCD的风险分别降低11%(AMED)、5%(DASH)、3%(AHEI)。因此该研究认为长期坚持和改善健康饮食模式对女性主观认知功能存在积极意义。该研究发现长期健康饮食模式与降低女性SCD存在关联;即使既往饮食质量不佳,后期饮食质量改善对于维持女性主观认知同样具有积极意义。原文链接:https://doi.org/10.1093/ajcn/nqab326 详情

2020年8月,吴息凤教授团队在《Journal for ImmunoTherapy of Cancer》上发表题为“Genetic associations of T cell cancer immune response-related genes with T cell phenotypes and clinical outcomes of early-stage lung cancer”的研究。该研究揭示了T细胞癌免疫应答相关基因与早期肺癌T细胞表型和临床结局的遗传相关性。T细胞相关免疫治疗的最新进展显著促进了非小细胞肺癌(NSCLC)的治疗。然而,T细胞癌免疫应答基因的遗传变异是否以及如何影响非小细胞肺癌患者的临床结局仍不清楚。为此,本研究评估了941例早期NSCLC患者(发现集n=536;验证集n=405)中280个T细胞癌免疫应答相关基因的2450个单核苷酸多态性(SNPs),以分析其与预后的关联,并观察其对T细胞表型的影响。研究发现,在发现集和验证集中位于10个基因的14个SNP与NSCLC的预后显著相关(p<0.05)。其中,TRB:rs1964986是荟萃分析后与复发风险最相关的变异(HR 1.84,95%CI 1.35 - 2.52,p=1.15E-04),而IDO1:rs10108662是与死亡风险最相关的SNP(HR 1.87,95%CI 1.40 - 2.51,p=2.17E-05)。多个不良基因型对死亡和复发风险具有累积影响。在单纯手术组和手术加化疗亚组中,七种治疗特异性变体在两个亚组中与预后的关联方向相反。表达量性状基因座分析表明,6个SNP与其相应的基因表达显著相关。用SNP定义的高危患者的T细胞脱颗粒减少(p=0.02),对癌细胞的细胞毒性降低(p<0.01)。基因表达谱显示高危受试者IDO1表达增加,IL2、PRF和GZMB表达降低。本研究揭示T细胞癌免疫应答途径的基因变异可影响预后,并可作为早期NSCLC患者治疗效果的预测因子。免疫基因型与T细胞抗肿瘤免疫之间的相关性表明宿主免疫遗传学与NSCLC预后之间存在生物学联系。图:不利基因型(UFGs)在体外T细胞癌免疫应答和T细胞脱颗粒中的作用 详情

衰老生物标志物研究对基础和转化医学均具有重大意义和价值。近年来基于年龄与DNA甲基化(一种重要的表观遗传修饰)之间的密切联系,学者们建立了可以表征衰老的DNA甲基化时钟(表观遗传钟),后者成为目前衰老最具前景的生物标志物。截至目前,已有超过10个DNA甲基化时钟被报道。尽管它们具有共同的理论依据(捕捉衰老信号),但它们与健康结局以及它们彼此之间的关联强度差异较大。此外,学界对它们所表征的潜在生物衰老过程也缺乏了解。近日,浙江大学公共卫生学院与耶鲁大学医学院的研究人员联合在老年医学领域国际顶级期刊《Aging Cell》(IF=9.3,中科院分区,生物1区)在线发表了题为“Underlying features of epigenetic aging clocks in vivo and in vitro”(表征衰老的DNA甲基化时钟在体内外的潜在特征)的最新研究成果。该研究首次全面比较了11个现有的DNA甲基化时钟,并在此基础上开发出一个更可靠且有效的新型DNA甲基化时钟“meta-clock”,具备比现有DNA甲基化时钟更强的全因死亡预测效力,并且更能区分肿瘤和正常组织,反映衰老特征,具有巨大的应用前景。在这项研究中,研究人员首先对目前已报道的11个DNA甲基化时钟所包含的CpG特征进行了详细比较,发现了它们之间较大的差异。随后,研究人员基于CD14+单核细胞和前额叶背外侧皮层(DLPFC)转录组数据,发现Horvath1、Horvath2、Hannum、Levine和Lin 这5个DNA甲基化时钟具有类似的转录组信号。进一步的网络分析鉴别出16个在CD14+单核细胞和DLPFC中的共表达基因模块(consensus expression module),而其中与DNA甲基化时钟密切相关的模块所涉及到的生物过程包括线粒体翻译、免疫、组蛋白修饰、自噬等。紧接着,研究人员发现在单核细胞中具有保守转录组信号的6个DNA甲基化时钟(Horvath1、Horvath2、Hannum、Levine、Lin和Yang时钟)能在一定程度上区分肿瘤组织(例如乳腺癌、结肠癌、肺癌和胰腺癌)与正常组织,其中Levine和Yang时钟效果最为显著。来自体外实验的数据提示,这6个DNA甲基化时钟中的某几个如Levine时钟与细胞衰老和线粒体耗竭这两个重要的衰老机制密切相关,后者进一步证实了前面的转录组分析结果。基于以上结果,研究人员提出假设:表观遗传衰老可能具有多重信号/机制,不同的DNA甲基化时钟可能在不同程度上反映了部分表观遗传衰老信号,通过识别重合信号或许能够构建出更加精确和有效的衰老生物标志物。为了验证这些猜想,作者使用来自全血、DLPFC、表皮/真皮和乳腺组织数据,对现有的DNA甲基化时钟所包含的CpG位点进行共甲基化模块聚类分析,通过数学模型,重新开发出一个新型DNA甲基化时钟——meta clock。进一步分析发现,相比现有的任一种DNA甲基化时钟,meta-clock具有更强的全因死亡预测效力,更能区分肿瘤和正常组织,且更能反映细胞衰老和线粒体耗竭;此外,meta-clock与阿尔茨海默病的病理学指标——神经纤维缠结合和缠结负荷密切相关。在文章的最后,研究人员写到:“这些发现是揭开DNA甲基化时钟的生物学基础的第一步,将有助于开发更加可靠和有效的衰老生物标志物,以用于临床和转化医学研究。更重要的是,揭示其生物学基础是发现衰老驱动因素并制定针对性干预措施的必要关键步骤”。本研究唯一第一作者为Zuyun Liu (刘足云),系浙江大学公共卫生学院研究员;唯一通讯作者为Morgan E Levine,系耶鲁大学医学院助理教授。本研究得到浙江大学医学院百人计划和美国国立卫生研究院衰老研究所相关经费支持。 详情

2018年7月,我院李雪研究员在风湿学年鉴杂志上在线发表题为“MR-PheWAS: exploring the causal effect of SUA level on multiple disease outcomes by using genetic instruments in UK Biobank”的研究论文。该论文利用全表型组关联研究(Phenome-wide association study, PheWAS)和孟德尔随机化(MR)方法,揭示了与尿酸(SUA)水平相关的遗位风险位点对多种复杂性疾病的影响及其可能的分子生物学通路。全表型组关联研究(Phenome-wide association study, PheWAS)是基于电子健康档案(EHR)数据中的国际疾病分类(ICD)代码,探索暴露因素和多种疾病关联的研究方法。该项研究工作建立了ICD-10/ICD-10-CM代码到全表型组学代码(PheCODE)的映射,为利用电子健康档案中ICD-10和ICD-10-CM数据进行全表型组学关联性研究奠定了重要的方法学基础。表型组学(phenomics)是生物体形态特征、功能、行为、分子组成规律等所有生物学性状的集合,是生物体内除了基因组外的另一半生命密码。从基因组角度获得遗传密码后,要继续解析疾病组表型密码,才能全面揭示人体生理和疾病发生发展机制。本研究利用首批英国生物样本库(UK Biobank)近15 万人的健康记录、生物样本、电子病历及基因组信息进行整合,研究纳入了约6 百万条电子病历(包含约10750个国际疾病分类(ICD)诊断代码),绘制了全表型组学框架(Phenome Framework)。李雪研究员基于新建立的全表型组学框架,确定了25个与血尿酸水平遗传风险基因座相关的疾病结局,包括高血压、高血糖和血脂异常等多种代谢特征表型。通过对这些交叉表型相关联的分子生物学通路进行分析,该研究首次揭示了尿酸和代谢性状之间共享的遗传/生物学通路可能与GCKR 和PTPN11/ATXN2 等基因功能的多效性有关。该项研究成果获得了欧洲抗风湿病联盟(EULAR) 的认可并提出了关于系统性筛查和评估痛风患者的心血管/代谢共病的建议。该工作得到了英国爱丁堡CRUK癌症研究中心、美国范德堡大学医学中心和中国留学基金委等机构的资助和支持。 详情

2007年12月,吴息凤教授团队在《Journal of Clinical Oncology》上发表题为“Projecting individualized probabilities of developing bladder cancer in white individuals”的研究。该研究构建了第一个膀胱癌发生风险预测模型。该研究包括678名白人膀胱癌患者和678名对照组。流行病学模型中的重要风险因素包括吸烟和接触柴油、芳香胺、干洗液、放射性物质和砷。该模型具有良好的鉴别能力(AUC=0.70;95%CI 0.67~0.73)。当纳入诱变剂敏感性数据时,AUC增加至0.80(95%CI 0.72~0.82)。模型在内部验证中表现出良好的一致性。该模型只需要一个人在临床诊疗期间回答几个简单的问题,就可以预测个体化概率。该模型可作为开发基于Web的膀胱癌风险评估工具的基础。本研究还开发了一个易于使用的风险评分。图1 预测模型的ROC曲线图2 病例对照的风险评分分布 详情

2017年12月,吴息凤教授团队在《International Journal of Epidemiology》上发表题为“Cohort Profile: The Taiwan MJ Cohort: half a million Chinese with repeated health surveillance data”的文章,介绍台湾美兆队列的总体设计和研究进展。台湾美兆队列由美兆健康管理集团建立,吴教授长期担任该集团的首席科学家。台湾美兆队列参与者由分布在台湾各地的体检和健康管理机构负责招募,是目前最大的、随访时间最长的亚洲人流行病学研究队列,已纳入近60万名年龄在20岁或以上的参与者。每位参与者都需要回答一份包括吸烟、饮酒、运动、饮食和睡眠等100项核心流行病学问题的问卷,参加共约103项的血常规、肝肾功能、身高、体重和肺活量等血液、尿液检测及体格检查。大约一半的参与者接受了多次体检和问卷调查。每位参与者都签署了一份知情同意书。通过匹配个人身份证号与台湾死亡登记和癌症发病监测数据库连接以获取癌症发病、死亡及死因数据。该队列研究将为癌症流行病学研究建立独特的丰富资源;剖析慢性疾病与癌症之间复杂的时间关系;为减少慢性疾病和癌症风险提供生活方式和行为的循证建议;确定慢性病和癌症的风险因素和共同的生物通路;识别常见癌症的高危人群;并识别常见癌症的微创早期检测标志物。图 1994~2011年研究对象招募时间流程图 详情

2016年6月,吴息凤教授团队在《International Journal of Epidemiology》上发表题为“Cohort Profile: The MD Anderson Cancer Patients and Survivors Cohort (MDA-CPSC)”的文章,介绍吴教授牵头组建的MD安德森癌症病人和生存者队列(MDA-CPSC)的总体研究设计。MDA-CPSC的建立是为了有力支撑针对种族多样和充分描述的新诊断患者群体的临床结果和生存的研究。该队列将患者病史数据库(PHDB)与核心流行病学数据、血液生物样本研究资源(BSRR)以及电子健康记录(EHR)和肿瘤登记系统(其中包含临床、病理、实验室测试、治疗和随访数据)结合在一起。该队列旨在广泛推进个性化医疗和循证生存护理的综合研究。潜在的研究领域包括:(i)发现、测试和验证潜在的流行病学决定因素、中间临床表型和血液生物标记物,以预测临床结局和生存终点;(ii)研究基线生活质量对临床终点的影响;(iii)调查症状的患病率、严重程度和治疗,发现这些症状的潜在机制,并通过循证临床试验改善症状管理;(iv)调查癌症诊断后的种族差异并鉴定这些差异的原因;(v)研究罕见癌症患者的预后、生活质量和症状;(vi)为临床结果和生存终点开发综合风险预测算法。MDA-CPSC登记所有符合条件的18岁及以上的新入院患者,在注册后1年内诊断出癌症,并为美国居民。截至2015年5月,该队列包括155 155名参与者。根据自我报告的种族/民族,大多数患者是白人, 7.26%为西班牙裔,6.97%为黑人。图MD安德森癌症病人和幸存者队列研究设计表 队列参与者癌症诊断情况 详情

2021年7月20日,周丹研究员在自然通讯杂志上在线发表题为“Contextualizing genetic risk score for disease screening and rare variant discovery” 的遗传结构(genetic architecture)及多基因风险评分创新研究工作。以高频遗传变异为基础的多基因风险评分(Polygenic Risk Score, PRS)是当前精准预防领域的研究热点,但其临床意义不如低频高致病突变,有待进一步挖掘。该工作创新性地将多基因风险评分(获取成本低)用于预测患者携带低频高致病性突变(获取成本高)的概率。已知高频和低频遗传变异对疾病易感性均有重要贡献,那么在患病人群中这两种遗传变异负担(burden)会不会出现类似“互斥”的规律? 该规律是否可以用于临床? 针对这些科学问题,课题组根据liability threshold疾病模型假设,结合小样本真实数据,推测并初步确认了高频低致病性变异(Polygenic burden, PB)和低频高致病性变异(Large-effect variant, LEV)的负担在病人中呈现负相关的关系 (该规律仅针对患病人群,外推到全人群会出现collider bias)。并进一步通过大量的模拟计算,从多个维度 (包括不同的遗传结构、变异的频率、遗传度、患病率、样本量等) 阐明了这个规律的适用条件及可能的影响因素。还通过UK Biobank数据库177,882例样本的全外显子组测序数据和10,533种表型数据,确认并命名该规律为“PB-LEV correlation”,同时开发了预测软件PB-LEV-SCAN。举例来说,在每1000个低PRS的青光眼患者中,会有约27个人存在MYOC基因的低频高致病性突变(stop-gain mutation),而在每1000个高PRS的青光眼患者中,仅有约6人携带这种突变。也就是说,通过高频变异信息,我们可以预测病人携带某个或者某些罕见高致病性突变的可能性。该研究的意义在于,通过低成本的高频突变信息识别出那些具有更高风险携带低频高致病性突变(需要昂贵的深度测序获得,但相对容易开展针对性的治疗)的病人,并根据携带低频突变的风险高低来优化研究资源、临床检测和治疗资源。该工作通过大规模的仿真计算,提出了PB-LEV correlation的假设,并在实际数据中得到了验证,独辟蹊径地研究并确认了一条多基因风险评分的应用途径。该推论增进了对复杂疾病遗传结构及不同类型变异间相互关系的理解,具有重要的临床意义。原文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-021-24387-z 详情

2017年4月,吴息凤教授团队在《International Journal of Epidemiology》上发表题为“Cohort Profile: The Mexican American Mano a Mano Cohort”的文章,介绍墨西哥裔美国人Mano a Mano队列的总体设计和研究进展。队列参与者是自我报告为墨西哥后裔的美国人(下称墨西哥裔美国人),在休斯顿大都会地区居住至少1年。从合格参与者的家庭中招募了最多三名个人。在队列开始时(即2001年)没有年龄限制;在2014年1月,纳入标准做了修改,只纳入年龄在35岁至75岁之间的男性和女性,以纳入患癌症和其他慢性疾病风险较高的人群。研究区域目前包括沿45号州际公路(I-45)的50个邮政编码地区,这些地区是墨西哥裔美国人传统居住地。截至2014年6月,从16600多个家庭招募了23606名成人参与者(18岁)。大多数队列参与者是女性(79%);入组时的平均年龄为40.8岁(±14.2岁),男性年龄略大于女性(分别为42.7岁和40.2岁);男性结婚比例(81.4%)高于女性(75.0%);大多数参与者(60%)没有高中毕业;近74%的参与者出生在墨西哥,但在美国平均生活了15.3年(±11.2年)。所有参与者在入组时会接受问卷调查,且每年接受一次随访。队列中90%的参与者留存了生物样本,其中56%有血样、63%有唾液样本、43%有尿液样本。基于该队列的研究大多集中于环境因素(例如人口背景、文化适应和社会经济地位)与健康行为(如吸烟和体育活动)之间的关系;以及健康行为如何影响身体发育和疾病,如肥胖、高血压、糖尿病和癌症。表1 参与者一般人口学特征表2 不同随访状态参与者基线数据 详情

徐小林老师在PLoS医学杂志上表题为“Progression of diabetes, heart disease, and stroke multimorbidity in middle-aged women: A 20-year cohort study”的研究论文。该论文通过对13714名45-50岁的基线无目标疾病的女性进行随访,评估20年间糖尿病、心脏病和脑卒中共病发生的轨迹,并探索其与社会人口学因素、生活方式因素和其他慢性病的关联,强调了在中年女性人群中提高对糖尿病、心脏病和脑卒中共病认识的重要性。近年来,糖尿病、心脏病和脑卒中共病的发病率不断攀升,且三者间存在着显著的交互作用。例如,糖尿病是心脏病和脑卒中公认的危险因素,而心脏病或脑卒中患者也可以进一步进展为糖尿病。然而,现有证据对这三种疾病的进展顺序和过程仍知之甚少。尽管有研究表明这三种疾病具有某些相同的危险因素,但暂无证据阐明这些共同危险因素纵向影响糖尿病、心脏病和脑卒中共病的积累过程。图1.糖尿病、心脏病和脑卒中不同组合之间纵向进展和转变的桑基图在本研究中,徐小林老师运用具有澳大利亚一项具有全国代表性的大样本纵向队列研究(Australian Longitudinal Study on Women’s Health,ALSWH)的数据,对没有糖尿病、心脏病和脑卒中疾病史的中年女性开展了研究。在3年一次的随访调查中,共病的进展被定义为从0或1种上述疾病进展为2或3种,或从2种上述疾病进展为3种。本研究共有16.8%的研究对象发生了两种或三种上述疾病。以随访中未新发上述疾病的女性为对照组,女性中发生共病进展的风险显著高于只新发一种上述疾病的风险。脑卒中的发生与其他慢性病进展的关联强度强于糖尿病和心脏病,婚姻状况(分居/离婚/丧偶)、出生地(非澳大利亚)、收入水平(对可用收入管理困难)、体型(超重/肥胖)、高血压、吸烟状况(现阶段吸烟)、慢性病(精神性疾病、哮喘、癌症、骨质疏松和关节炎)等因素均与糖尿病、心脏病和脑卒中共病的进展显著相关。该研究表明生活方式干预和其他慢性病的治疗对预防糖尿病、心脏病和脑卒中共病的进展有重要意义,尤其对于患有脑卒中的女性。 详情

2019年11月,我院李文渊研究员在Environment International杂志发表题为“Weather, ambient air pollution, and risk of migraine headache onset among patients with migraine”的研究论文。该论文探索了温度、相对湿度、大气压力和环境空气污染物与偏头痛发作的关系。该研究共收集了超过4400天的睡眠数据,是当时客观测量睡眠且随访时间最长的关于睡眠与偏头痛的研究项目。偏头痛作为一种常见的原发性头痛,影响因素复杂。以往的研究发现睡眠不足、压力、饮酒、咖啡因、异常天气和空气污染等都可能是偏头痛发病的危险因素。然而,大部分该类研究依赖于调查问卷数据而缺乏客观记录。一些流行病学研究通过每日头痛调查问卷客观测量了天气数据,并前瞻性收集了偏头痛事件。然而早期研究受到分析方法的限制,过去二十年的研究认为部分偏头痛患者更易受天气影响,空气污染水平可能会受到区域气候的影响,结果仍有待进一步验证。该队列研究纳入了98名间歇性或偶发性偏头痛患者,并随访至少6周。每位患者每天回答两次网络电子调查问卷,并佩戴腕式活动记录仪客观记录其睡眠时间与睡眠质量。本研究共收集了超过4400天的睡眠数据,通过采用个体重复测量的方法分析了每日天气条件及空气污染水平对偏头痛发作的影响,结果表明天气因素及空气污染对偏头痛发作的影响呈现一定的季节性,夏秋季(4月至9月)高度潮湿的环境以及冬春季(10月至3月)较高的交通相关空气污染物水平都与偏头痛发作相关。 详情

2021年10月21日,浙江大学健康医疗大数据研究院雷浩讲师以第一作者在中科院医学1区top期刊Infectious Diseases of Poverty在线发表研究论文“Increased urbanization reduced the effectiveness of school closures on seasonal influenza epidemics in China”。该研究分析了过去10年中国的流感监测数据,研究了中国不同省份关闭学校在控制流感传播中的作用,研究发现,在北京天津上海这种高度城市化的省份,关闭学校在控制流感传播中没有显著作用,但在浙江,安徽,江苏,河北这种城市化率相对较低的地区,关闭学校在控制流感传播中有显著的正作用。并且随着城市化率增加,关闭学校在控制流感传播中的作用线性下降。该研究进一步分析了城市化影响关闭学校在控制流感传播中的作用的机理,研究发现主要原因是随着中国的城市化进程,儿童在人群中的比例越来越低,因此儿童在流感传播中的作用也在降低,因此关闭学校在控制流感传播中的效果也会减弱。该研究对中国制定具有针对性的流感防控政策具有理论指导意义。原文链接:https://idpjournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40249-021-00911-7 详情

胡可嘉博士近年来在高温健康风险评估及区划、气温与多种疾病死亡之间的暴露-反应关系研究以及其他环境、气象因素在极端气温的死亡影响中混杂/交互效应研究取得了较有创新性的成果,近年来共发表SCI论文近30篇,篇均影响因子超过6,其中4篇入选ESI高水平论文,总被引1000余次(Google Scholar统计)。主要成果包括:(1)在气温-死亡关系与死亡效应的影响因素方面,基于长时间序列的死亡登记数据以及气象观测数据,发现中国浙江农村地区人群的极端气温死亡风险显著高于城市地区人群,论文以共同第一作者(第一位)发表在环境健康领域顶级期刊《Environmental Health Perspectives》上,并入选2020年ESI高水平论文,研究成果被包括Scidev、IIASA NEXUS、环球科学在内的知名国内外科学媒体广泛报道。文章主要结论挑战了以往西方学术界认为由于城市热岛效应,城市地区人群高温健康风险高于农村地区人群的认知,认为中国城市和农村在年龄结构、收入、教育程度、空调、医疗资源拥有量等社会经济因素方面的差距导致了极端气温死亡风险存在巨大差异,该论文发现的影响极端气温死亡风险的脆弱性因素可以相关公共卫生干预政策提供重要参考。图1.气温-死亡关系的城乡差异(2)在高温风险评估建模及区划制图方面,融合高分辨率气象观测数据、多源遥感融合的人居指数数据以及社会经济脆弱性数据,建立栅格尺度上的极端高温风险评估模型,进行了1km分辨率的浙江省高温风险评估与制图,论文以第一作者发表在环境领域顶级期刊《Environmental Science and Technology》上,随后已有发表在《Nature Communications》等杂志上的多篇论文肯定了本论文提出的模型,并在此基础上进行了发展。图2. 浙江省高温风险评估及区划图(3)在气温-死亡关系的其他混杂、交互因素方面,拓展了气温变率的评估方法,发展了一种时空气温变率指数,用以评估短期气温波动对健康的影响。相关文章以共同第一作者(第一位)身份发表在环境领域期刊《Science of The Total Environment》以及《Environmental Research》上。研究了不同粒径颗粒物PM1、PM2.5以及PM10对死亡的短期效应,论文以共同第一作者(第一位)身份发表在环境流行病学领域知名期刊《Environmental International》上,是国内首篇在多城市尺度上探讨PM1和死亡关系的论文。(4)参与了全球包括中国、美国、英国、巴西、伊朗等多个国家和地区气温相关的多种疾病死亡率、住院率、急诊入院等不同健康结局的风险研究,相关成果发表在《Plos Medicine》、《Environmental Health Perspectives》、《Environment International》、《Environmental Pollution》等国际顶级医学以及环境健康领域期刊上。 详情

2021年9月22日,我院杨杰研究员在JAMA Network Open杂志上在线发表题为“Assessing the Prognostic Significance of Tumor-Infiltrating Lymphocytes in Patients With Melanoma Using Pathologic Features Identified by Natural Language Processing”的研究论文。该论文在哈佛医学院附属Brigham and Women’s Hospital 2004至2019年的皮肤癌患者的病理学报告中(1.4万人共2.2万份病理学报告),利用自然语言处理技术自动构建黑色素瘤患者病理结果数据库,经过过滤筛选得到2624名规模庞大的有效患者(比先前相关研究最大样本要高出约一倍),并在此数据库的基础上证实了Brisk的TILs 是一个黑色素瘤患者的独立的预后风险因素。杨杰研究员是本文的第一作者,哈佛大学医学院副教授Li Zhou是本文的通讯作者。本研究利用自然语言处理和机器学习技术,自动化地从海量电子病历中挖掘并且构建大规模的患者数据库,并在此基础上进行了经典的患者预后因素分析。本研究为人工智能辅助医学研究探索了一条新的研究路线。原链接:https://jamanetwork.com/journals/jamanetworkopen/fullarticle/2784429图:不同TILs 状态下黑色素瘤患者生存曲线 详情

2019年12月,吴息凤教授团队在《Journal for ImmunoTherapy of Cancer》上发表题为“Soluble immune checkpoint-related proteins as predictors of tumor recurrence, survival, and T cell phenotypes in clear cell renal cell carcinoma patients”的研究。该研究揭示了肾透明细胞癌复发、生存和T细胞表型相关的预测因子。免疫检查点抑制剂在癌症免疫治疗中取得了前所未有的成功。除了少数候选生物标记物外,可溶性免疫检查点相关蛋白在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者中的预后作用基本上尚未研究。本研究采用多重Luminex分析法分析了182例ccRCC患者14种免疫检查点相关蛋白(BTLA、GITR、HVEM、IDO、LAG-3、PD-1、PD-L1、PD-L2、Tim-3、CD28、CD80、CD137、CD27和CTLA-4)的循环水平及其与复发和死亡风险的关系。研究人员分析了部分患者研究人群(n=47)和来自TCGA的533例原发性ccRCC的肿瘤组织基因表达,以阐明潜在的机制。我们的主要终点是总体生存;次要终点是无复发生存率。本研究采用多变量Cox比例风险模型、非条件logistic回归模型和Kaplan-Meier分析。结果显示,sTIM3和sLAG3与进展期(III期)疾病显著相关(P<0.05)。sPD-L2是复发的最强预测因子(HR 2.51,95%CI 1.46-4.34,P=9.33E-04),而高sBTLA和sTIM3与生存率降低相关(HR 6.02,95%CI 2.0-18.1,P=1.39E-03和HR 3.12,95%CI 1.44-6.75,P=3.94E-03)。基于sTIM3和sBTLA的风险评分表明,联合两个可溶性免疫检查点相关蛋白可预测ccRCC的复发和死亡风险(P=0.01和4.44E-04)。此外,sLAG3和sCD28与肿瘤中T细胞的细胞溶解活性呈负相关(rho分别为-0.31和-0.33)。本研究证明可溶性免疫检查点相关蛋白可能与ccRCC患者的进展性疾病、复发和生存相关,提示了可溶性免疫检查点相关蛋白的预后价值。图1 ccRCC患者可溶性免疫检查点蛋白水平的无复发生存期(RFS)和总生存期(OS)的Kaplan Meier分析图2 可溶性免疫检查点的风险评分作为ccRCC生存的预测因子及其与原发肿瘤T细胞功能的相关性 详情

2018年2月,陈辰讲师以第一作者在Cancer Epidemiology期刊发表题为“Epithelial ovarian cancer mortality among Hispanic women: Sub-ethnic disparities and survival trend across time: An analysis of SEER 1992–2013” 的研究论文。该研究基于美国国家癌症登记数据,拓展并更新了针对美国西班牙裔卵巢癌患者的亚种族生存差异及生存趋势的研究结论。该研究发现卵巢癌病理分期分型及预后均存在亚种族间差异。其中Puerto Rican亚族的总体及卵巢癌特异性五年生存率均显著低于Mexican、South or Central American (SCAs) 及其他西班牙裔亚种族患者,且在调整了人口学特征、病理特征及社会环境特征之后,此亚种族差异仍保持显著。此外,此研究发现,在1992-2008年间,虽然美国其他主要种族(如白人、非裔及亚裔)卵巢癌生存率均有显著上升趋势,然西班牙裔患者的生存率并未得到改善,提示美国西班牙裔患者在治疗和预后方面未体现出与其他种族同等的健康获利。此研究发表时,是为针对美国西班牙裔女性卵巢癌亚种族差异研究中涉及时间跨度最广,研究样本人群最具代表性的研究之一,且基于社会生态学原理,综合考察了个人因素及社会环境因素的综合效应。 揭示并强调了在卵巢癌相关研究、治疗方案及健康促进方案制定过程中根据亚种族特征及差异进行分析、讨论及执行的必要性。图:美国西班牙裔卵巢癌患者总体(A)及卵巢癌特异性(B)五年生存趋势 详情

2011年8月,吴息凤教授团队在《Lancet》上发表题为“Minimum amount of physical activity for reduced mortality and extended life expectancy: a prospective cohort study”的研究。该研究基于美兆健康人群筛检队列,报道了运动时间、运动量与死亡及预期寿命的关系。目前,该文已累计被引用近2000次。体育运动对健康的好处众所周知,但每周少于150分钟的运动是否会对预期寿命有好处尚不清楚。基于此,研究纳入了近42万名参与者,根据自填问卷中显示的每周运动量,参与者被分为五类运动量中的一类:不活动、或低、中、高或非常高的活动量。计算了参与运动的各组与非活动组相比的死亡率风险的危险比(HR),并计算了各组的预期寿命。结果显示:与非活动组相比,每周平均运动92分钟或每天运动15分钟的低运动量运动组的全因死亡率降低了14% (HR 0.86, 95% CI 0.81-0.91),预期寿命延长了3年。每天至少运动15分钟基础上每多运动15分钟,全因死亡率进一步降低4%(95% CI 2.5-7.0),全因癌症死亡率进一步降低1%(0.3%-4.5%)。运动的益处适用于所有年龄组和性别,以及有心血管疾病风险的人群。与低容量组相比,不活动的个体死亡率增加17%(HR 1.17,95% CI 1.10-1.24)。该研究揭示每天走路15分钟,即可延长寿命3年,减少死亡率14%。图:每日体育活动持续时间和全因死亡率降低的关系 详情

2018年1月,吴息凤教授团队在《BMJ》上发表题为“Cancer risk associated with chronic diseases and disease markers: prospective cohort study”的研究。该研究揭示了慢病导致的癌症风险与五大最大生活方式风险因素的总和相当。该研究获得广泛媒体报道,《自然综述-肾脏病学》和《新英格兰医学杂志观察》对该研究发表专题评述。该研究使用了台湾MJ队列近50万参与者的大数据。研究发现与心血管疾病、糖尿病、慢性肾脏疾病、肺部疾病和痛风性关节炎相关的标记物具有相当大的癌症风险。这些标志物共贡献癌症发生率的20.5%和癌症死亡率的38.9%,与吸烟、身体活动不足、水果和蔬菜摄入不足、饮酒和不理想的BMI这五个最大的生活方式风险因素的总和相当。慢性疾病风险评分最高的个体寿命缩短近16年。这些结果支持具有与主要慢性疾病相关的异常生物标志物的个体属于肿瘤高危个体。未来的癌症预防策略应将慢性疾病的管理作为可改变的风险因素。 详情

2018年7月,吴息凤教授团队在《Gut》上发表题为“The somatic mutation landscape of premalignant colorectal adenoma”的研究。该研究构建了结直肠腺瘤基因突变图谱并揭示了从结直肠腺瘤进展到癌症的分子生物标志物。该研究通过对149例腺瘤标本和配对血液标本进行了全外显子组测序和靶向测序。将鉴定出的体细胞突变与来自TCGA的结直肠癌(CRC)样本中的体细胞突变进行比较。确定了从大肠腺瘤到腺癌进展的分子标志物。研究发现,在非晚期和晚期常规腺瘤和大肠癌组织中,经多重比较调整后,TP53、PIK3CA、KRAS、APC和SMAD4五个基因的非沉默突变频率具有统计学意义差异。例如,大肠腺瘤中的TP53突变完全是错义突变,而大肠癌中四分之一的突变是截断突变。用随机森林分类法,鉴别出促进腺瘤进展到结直肠癌的20个最重要基因,模型AUC达0.941。图1 基因突变频率与疾病进展的关系图2 从传统腺瘤到非高突变结直肠癌恶性进展的预测模型 详情

2009年9月,吴息凤教授团队在《Nature Genetics》上发表题为“Genetic variation in the prostate stem cell antigen gene PSCA confers susceptibility to urinary bladder cancer”的研究。该研究鉴定了膀胱癌的新型遗传易感位点。该研究对来自德克萨斯州的969例膀胱癌病例和957例对照进行了全基因组关联研究。为了快速验证,研究在另外三个美国人群中评估了60个SNP位点,并在九个欧洲人群中验证了最显著的SNP。在美国和欧洲人群中,发现PSCA基因中的错义变异(rs2294008)与膀胱癌易感性具有一致的关联。综合所有受试者(6667个病例、39590个对照),总体P值为2.14×10-10,等位基因比值比为1.15(95%CI 1.10-1.20)。rs2294008改变基因起始密码子,预计会导致初级PSCA翻译产物N端信号序列中的九个氨基酸被截断。体外报告基因分析显示,变异等位基因显著降低启动子活性。PSCA基因组区域的重新测序显示rs2294008是PSCA基因中唯一常见的错义SNP。该研究表明rs2294008是一个新的膀胱癌遗传易感位点。图:8q24位点包含rs2294008 详情

2020年10月5日,周丹研究员在自然遗传杂志上在线发表题为“A unified framework for joint-tissue transcriptome-wide association and Mendelian randomization analysis” 的遗传流行病学方法学论文,创新优化了转录组关联分析。近些年,以PrediXcan为代表的转录组关联分析 (Transcriptome-wide association study, TWAS) 被广泛地应用在寻找复杂表型关联基因的遗传流行病学研究中。与基因组关联分析 (Genome-wide association study, GWAS) 相比,TWAS以转录调控作为遗传变异与表型之间的中介,将单个遗传变异与表型的关联转换成基因/转录本与表型的关联。TWAS的研究过程主要可以分成两个步骤:第一,利用基因附近(cis)的遗传变异信息构建转录水平预测模型;第二,利用模型预测研究对象的基因表达水平,并与表型做关联分析。该研究策略的优势包括:(1) 相比SNP,以基因为单位的分析具有更低的多重比较次数;(2) 结果以基因的形式呈现,其生物学意义更为直接,便于后续功能研究及成果转化;(3) 相比转录组单组学研究,以胚系基因组遗传变异为基础的转录组研究不会出现因果倒置的问题,且受混杂因素的影响较小; (4) GTEx数据库已提供了极为丰富的基因组、转录组数据,研究者可利用多达49种人体组织、细胞的资料作为参照建立模型,无需额外的样本检测即可实现从GWAS到TWAS的跃迁。虽然TWAS已获得了广泛的认可,但该研究方法仍然存在改进的空间。新方法MR-JTI在两个方面对TWAS进行了创新优化:第一,通过提高模型的预测精度增加关联分析的检验效能(power);第二,解决横向基因多效性(horizontal pleiotropy) 及潜在混杂因素带来的假阳性问题。该工作针对难点问题建立了多组织联合预测的研究方法JTI(Joint-Tissue Imputation)和基于孟德尔随机化框架的MR-JTI方法,并开发了应用软件。该方法通过借助相似组织的信息提升模型的预测精度以增加检验效能。受组织转录调控相似性的启发,原创性地融合了ENCODE等数据库中启动子区域染色质可及性和转录图谱信息,解决了如何系统化地借助组织、细胞间转录调控的相似性规律,增加基因表达预测精度的关键科学问题。交叉验证结果显示,预测精度平均提升了60.3%。同时,为解决研究中可能存在的由横向基因多效性引起的假阳性问题,创新性地将可能存在的横向基因多效性纳入模型,并通过threshold bootstrap LASSO的方法巧妙地解决了如何将工具变量的横向与纵向基因多效性分离,得到近似无偏估计值,提升因果证据强度的关键科学问题。该工作提供了所有基于2020年9月最新发布的包含人体49种组织细胞的GTEx v8基因表达数据预测模型以供下载应用。模型以.db的格式给出,与PrediXcan相一致。同时给出的还有SNP-SNP的协方差矩阵,以便熟悉S-PrediXcan的读者将最新的模型无缝地衔接到关联分析中去。该工作整合了包括基因组(GTEx)、转录组 (GTEx)、表观修饰组 (ENCODE, Roadmap)的信息,利用多个大型数据库 (PsychENCODE, GEUVADIS, UK Biobank, BioVU),不仅优化了转录组关联分析的策略,还提供了最新的数据资源以便读者使用,为复杂疾病的遗传流行病学研究提供了新的思路和资源。原文链接:https://www.nature.com/articles/s41588-020-0706-2 详情

2021年2月5日,我院徐欣课题组在阿尔茨海默病与痴呆杂志上在线发表题为 “SINgapore GERiatric intervention study to reduce physical frailty and cognitive decline (SINGER)–pilot: A feasibility study” 的研究论文。该论文探究了多领域生活方式干预对社区老年人躯体衰弱及认知功能的影响,并讨论了该干预方式在亚洲国家初级卫生保健系统下大范围推广的接受度及可行性,研究结果为痴呆防治与干预提供了新思路。徐欣研究员为本文共同第一作者及独立通讯作者。痴呆不仅给患者个人及其家庭,乃至社会都带来沉重的负担。由于痴呆存在异质性和复杂性,聚焦单一维度的干预效果不显著,其长期有效性仍不明确,因此,针对多项危险因素的多领域生活方式干预为痴呆的预防提供了希望。徐欣研究员作为全球多领域生活方式干预-WW-FINGERS(World Wide FINGERS, WW-Fingers)战略合作网络的联盟成员,在新加坡开展了相关的干预研究(SINGER),旨在探索多领域生活方式干预在亚洲国家实施的本土化调整。在本论文中,徐欣课题组对新加坡社区老年人开展了为期2年的随机对照临床试验,对干预组和对照组分别实施亚洲本土化多领域生活方式干预(SINGER)与已在欧洲人群中得到验证的干预模式(FINGER),干预内容主要包括认知干预、营养指导、体育锻炼、血管和代谢危险因素管理四个维度。研究结果显示试验中干预完成度为80%,且两种干预均能显著提高受试者躯体功能水平,除此之外,SINGER组受试者在血压控制方面表现更佳。该研究展现了多领域生活方式干预在痴呆预防中的积极作用,且该干预模式的本土化调整在亚洲社区老年人中有广阔的应用前景。该工作得到了Miia Kivipelto博士, Tiia Ngandu博士,Alina Solomon博士和FINGER 团队的帮助。原文链接:https://alz-journals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/trc2.12141图:亚洲本土化多领域生活方式干预(SINGER)的干预内容及时间轴 详情